核酸是重要的生物信息分子,是分子生物學(xué)的主要研究對象之一。利用
核酸提取試劑提取細菌基因組DNA/RNA可用于PCR擴增、分子雜交、核酸檢測分析、基因突變檢測和測序等,而核酸提取的質(zhì)量對實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性影響很大。那么如何更好的獲得細菌基因組DNA/RNA?慧慶生物結(jié)合具體的實驗成果為大家分析一下。
實驗論證:如何更好的獲得細菌基因組DNA/RNA
1.實驗?zāi)康?/strong>
用自動核酸提取純化儀能夠成功提取細菌基因組DNA,并獲得較好的電泳條帶。
2.實驗儀器及試劑
儀器:臺式離心機(SIGMA)、超微量分光光度計(Q5000)、電泳儀(北京六一儀器廠,DYY-7C型)、自動核酸提取儀(LJbio32H)
試劑:細菌基因組DNA提取試劑盒(磁珠法、預(yù)分裝)
3.實驗方法
(1)樣本處理:取過夜培養(yǎng)的細菌100~1000 μL(細胞數(shù)為108-109)至1.5 mL 離心管中10000g離心2min,吸棄上清,再加入200 μL EB重懸菌體備用。
(2)按照試劑盒說明書手工操作,提取細菌基因組DNA。
(3)優(yōu)化自動核酸提取純化儀的上機參數(shù)(①65℃裂解,8min ②65℃裂解,10min ③室溫裂解,10min)。
(4)用超微量分光光度計測量提取的DNA,并進行電泳檢測。
4.實驗結(jié)果
(1)在超微量分光光度計上用EB潤洗點點空白,取1-2 μl的洗脫產(chǎn)物檢測,記錄各個波長的吸光度,得到的數(shù)據(jù)如下:
表1 核酸提取純化儀提取結(jié)果
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序號
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A260/A280
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A260/A230
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Conc(ng/μL)
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備注
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1.
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1.98
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1.51
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186.6
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65℃8min4級
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2.
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1.95
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1.42
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183.7
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3.
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1.92
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1.39
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163.3
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65℃10min4級
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4.
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2.02
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1.69
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150.1
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5.
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1.76
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0.95
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176.9
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室溫10min4級
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6.
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1.89
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1.24
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380.6
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備注:加底紋的電泳
(2)在1%的瓊脂糖凝膠上加入6μL洗脫的基因組DNA/擴增產(chǎn)物/DNA Marker進行電泳,結(jié)果如下:
M:DL2000Ladder
1:65℃裂解,8min;2-3: 65℃裂解,10min;4-5: 常溫10min
5.分析與討論
(1)由濃度測量結(jié)果和產(chǎn)物電泳圖可知,三種提取條件下純度與純度稍有差異,室溫裂解條件下,電泳結(jié)果點樣孔有滯留,裂解效果比其他兩種稍差,但也有明顯DNA帶與兩條RNA條帶。
(2)電泳圖編號4 的DNA條帶略暗,與測量結(jié)果也能對應(yīng)起來,分析原因是提取所用耗材此孔位對應(yīng)的磁棒套稍長一點,儀器提取過程中磁棒套攪拌過程中影響其裂解效果,導(dǎo)致此孔提取核酸測量值與電泳結(jié)果稍差。
(3)對比三種程序提取效果,65℃裂解8min的測量值較均一,重復(fù)性較好,DNA條帶最亮。
如何更好的獲得細菌基因組DNA/RNA?看了以上的實驗過程以及結(jié)果分析,相信大家已經(jīng)有了更深入的認識。洛陽慧慶生物生產(chǎn)的細菌基因組DNA提取試劑(磁珠法)核酸提取成功率更高、價格適中,受到高校及科研單位用戶的好評。如您有相關(guān)疑問或者采購需求,請留言或者電話聯(lián)系我們。